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應(yīng)用HaloTag pull-down技術(shù)鑒定了與胡楊CPK21互作的重金屬脅迫相關(guān)蛋白

更新時(shí)間:2024-01-29   點(diǎn)擊次數(shù):1901次

鎘(Cd)污染因其毒性在全球范圍內(nèi)造成了嚴(yán)重的生態(tài)問題,重金屬對(duì)植物造成的傷害除了離子毒害效應(yīng),還會(huì)影響植物的水分狀況,造成植物生理干旱。當(dāng)前,干旱也已成為全球農(nóng)林業(yè)生產(chǎn)和發(fā)展的重大威脅。

胡楊(Populus euphratica)是廣泛分布于我國(guó)西北干旱、鹽堿地區(qū)的一種高大喬木,具有很強(qiáng)的抗旱耐鹽能力,并且能夠吸收和積累重金屬,是研究樹木抗逆生理和分子機(jī)制的重要模式樹種。

鈣(Ca2+)是植物感知生物和非生物脅迫的典型信號(hào)分子,Ca2+信號(hào)和cpk對(duì)廣泛的環(huán)境刺激做出反應(yīng),并協(xié)調(diào)信號(hào)網(wǎng)絡(luò)和生理反應(yīng)(Poovaiah等,2013)。然而,Ca2+信號(hào)和cpk是否調(diào)節(jié)植物對(duì)重金屬的反應(yīng)很少被研究。

2023年12月19日,北京林業(yè)大學(xué)陳少良教授課題組研究成果,發(fā)表在Plant Stress期刊上(影響因子5.0),文章題目為Populus euphratica CPK21 interacts with heavy metal stress-associated proteins to mediate Cd tolerance in Arabidopsis。


該研究借助HaloTag pull-down技術(shù),富集了PeCPK21相互作用蛋白,Cd處理后相應(yīng)的表達(dá)譜表明,PeCPK21與重金屬脅迫相關(guān)蛋白(HMAPs)相互作用,介導(dǎo)了轉(zhuǎn)基因擬南芥對(duì)Cd的耐受性。


1.Cd處理的胡楊中的PeCPK21表達(dá)

PeCPK21的表達(dá)在根和葉中不同。葉片中,PeCPK21轉(zhuǎn)錄物在CdCl2處理3小時(shí)后增加,6小時(shí)達(dá)到峰值,隨后迅速下降,12h后進(jìn)一步增加。根系中,Cd處理12 h后PeCPK21顯著增加,24h達(dá)到峰值,而后迅速下降。


2.Cd激活擬南芥PeCPK21啟動(dòng)子表達(dá)

胡楊PeCPK21啟動(dòng)子構(gòu)建PeCPK21pro轉(zhuǎn)到擬南芥中。無CdCl2脅迫,根、子葉和下胚軸中GUS信號(hào)濃度較低。CdCl2脅迫,根,子葉和下胚軸中的GUS活性增加。結(jié)果表明Cd激活PeCPK21,PeCPK21在胡楊根葉表達(dá)增加。

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3.PeCPK21轉(zhuǎn)基因擬南芥的Cd耐受性

作者選擇8個(gè)PeCPK21轉(zhuǎn)基因擬南芥品系,確定其在鎘脅迫下的作用。RT-qPCR表明,在轉(zhuǎn)基因系中表達(dá)高,OE2中表達(dá)高,OE8低。之后選OE3、OE7和OE10轉(zhuǎn)基因幼苗進(jìn)行鎘實(shí)驗(yàn)。CdCl2處理WT、VC和三個(gè)轉(zhuǎn)基因系確定鎘耐受性的表型差異,結(jié)果表明,在CdCl2脅迫下,PeCPK21正調(diào)控轉(zhuǎn)基因擬南芥根長(zhǎng)、鮮重和膜穩(wěn)定性。

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4.根系中細(xì)胞鎘的積累和鎘通量

Cd熒光探針檢測(cè)根部細(xì)胞Cd含量。用CdCl2處理后,所有根細(xì)胞熒光顯著增加,轉(zhuǎn)基因擬南芥熒光強(qiáng)度相對(duì)較低,對(duì)照組幾乎無熒光,這表明PeCPK21抑制Cd在擬南芥根積累。NMT監(jiān)測(cè)擬南芥幼苗根尖中Cd通量,對(duì)照組中根頂端區(qū)域通量低,幼苗中Cd通量高,而轉(zhuǎn)基因系OE3、OE7和OE10的Cd2+通量顯著降低。


5.H2O2積累和抗氧化酶活性

Cd積累促進(jìn)植物細(xì)胞產(chǎn)生ROS。用熒光探針H2DCF-DA測(cè)定根部細(xì)胞H2O2濃度。CdCl2處理后,所有擬南芥熒光強(qiáng)度均顯著增加,轉(zhuǎn)基因系中Cd誘導(dǎo)的H2O2增加降低,對(duì)照組DCF熒光非常低。檢測(cè)CAT、APX、POD和SOD的總活性,確定PeCPK21過表達(dá)植株在鎘脅迫下不產(chǎn)生ROS。CdCl2脅迫下所有品系的APX、POD和CAT活性增加,OE3、OE7和OE10活性最高。但CdCl2抑制SOD的活性,WT、VC和PeCPK21過表達(dá)的品系中沒有顯著差異。


6.擬南芥中PeCPK21相互作用的蛋白

為探究PeCPK21介導(dǎo)Cd和ROS穩(wěn)態(tài)的功能,用HaloTag pull-down技術(shù)富集與PeCPK21相互作用蛋白。該實(shí)驗(yàn)過程是使用體外真核蛋白表達(dá)系統(tǒng)將PeCPK21表達(dá)出來,再與胡楊的總蛋白進(jìn)行Pull down實(shí)驗(yàn),最后將與PeCPK21結(jié)合的蛋白進(jìn)行質(zhì)譜鑒定。

與PeCPK21相互作用的HaloTag pull-down富集蛋白列中,分為四組:

(I)陽離子/重金屬轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白、膜聯(lián)蛋白、K+–H+交換樣蛋白(KHEP)、鈣單向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白、銅轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白5(COPT5)、寡肽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白3(OPT3)、植物防御素樣蛋白2.2(PDF2.2)、PM相關(guān)陽離子結(jié)合蛋白(PCAP1)和ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白I家族成員6(ABCI6);

(II)質(zhì)子泵亞基、V型質(zhì)子ATP酶亞基a3(VHAa3)、VHA-B1、VHA-C、焦磷酸鹽活化膜質(zhì)子泵2(AVPL1)和V型質(zhì)子ATP酶蛋白脂質(zhì)亞基(AVA-P2);

(III)抗氧化酶,類囊體抗壞血酸過氧化物酶(TAPX),超氧化物歧化酶(MSD1),抗壞血酸過氧化物酶1(APX1),APX2,APX3,硫氧還蛋白M4(TRXM4),9-順式環(huán)氧類胡蘿卜素雙加氧酶(NCED1),GPX3,硫氧還蛋白樣蛋白CDSP32和硫氧還蛋白超家族蛋白(PRXQ);

(IV)膜內(nèi)源蛋白、質(zhì)膜內(nèi)源蛋白1;1(PIP1-1)、PIP2-6、PIP2-7、PIP2A和tonoplast內(nèi)源蛋白。

7.PeCPK21相互作用蛋白的轉(zhuǎn)錄本分析

7.1陽離子/重金屬轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的轉(zhuǎn)錄

通過鈣滲透通道介導(dǎo)Cd進(jìn)入的膜聯(lián)蛋白的轉(zhuǎn)錄被CdCl2上調(diào),在PeCPK21-OE3、7、10中低于WT和VC。CdCl2增加擬南芥中鈣單向轉(zhuǎn)運(yùn)體、KHEP、COPT5、OPT3和PDF2.2的表達(dá),但在PeCPK21過表達(dá)系中觀察到更高的水平。然而,用CdCl2處理所有樣品中PCAP1和ABCI6的轉(zhuǎn)錄并未顯著改變。


7.2質(zhì)子泵亞基的轉(zhuǎn)錄

CdCl2處理增加了所有測(cè)試品系中VHA-B1、VHA-C、AVPL1和AVA-P2的表達(dá)。與WT和VC相比,VHAB1、VHA-C和AVA-P2的Cd誘導(dǎo)在PeCPK21過表達(dá)的品系中更為明顯。然而,在所有測(cè)試品系中,VHA-a3的轉(zhuǎn)錄均未改變。

7.3抗氧化酶的轉(zhuǎn)錄

所有測(cè)試品系證明CdCl2上調(diào)PeCPK21相互作用的幾種抗氧化酶的表達(dá)。與WT和VC相比,這些抗氧化酶TAPX、APX1、APX2、TRXM4、NCED1、GPX3、CDSP32、PRXQ在PeCPK21-OE3、7、10中表達(dá)量高。


7.4膜內(nèi)源蛋白的轉(zhuǎn)錄

CdCl2脅迫后,PIP1-1、PIP2A和PIP2-7的轉(zhuǎn)錄水平增加,與WT和VC相比,PeCPK21過表達(dá)植物的水平更高。CdCl2處理不影響PIP2-6和TIP1的轉(zhuǎn)錄。

小結(jié):

綜上所述,Cd通過激活PeCPK21啟動(dòng)子上調(diào)胡楊PeCPK21的轉(zhuǎn)錄。鈣傳感器PeCPK21可以提高植物對(duì)Cd脅迫的耐受能力,表現(xiàn)為過表達(dá)PeCPK21的擬南芥的根和全株生長(zhǎng)減少較少。HaloTag pull-down富集蛋白和相應(yīng)的表達(dá)譜表明,PeCPK21通過與多種重金屬脅迫相關(guān)蛋白相互作用,限制Cd積累,增加ROS清除,改善轉(zhuǎn)基因擬南芥的水分狀況,從而提高Cd耐受性。


HaloTag Pull down技術(shù)簡(jiǎn)介

體外蛋白表達(dá)與Pull down技術(shù)相結(jié)合,表達(dá)出目的蛋白和標(biāo)簽蛋白(Halo,GST,His等)的融合蛋白,不受抗體和物種限制,僅借助標(biāo)簽的親和介質(zhì)將目標(biāo)蛋白純化出來,使用Pull down技術(shù),將目標(biāo)蛋白與互作的蛋白“下拉",進(jìn)而利用Western Blot或者質(zhì)譜鑒定互作蛋白。蛋白Pull down實(shí)驗(yàn)還可以同時(shí)表達(dá)兩個(gè)蛋白,進(jìn)行點(diǎn)對(duì)點(diǎn)的互作驗(yàn)證,也可以僅表達(dá)蛋白質(zhì)的結(jié)合區(qū)域,確定兩個(gè)蛋白結(jié)合的結(jié)構(gòu)域。

本公司能夠提供Halo,GST或FLAG等多種標(biāo)簽的Pull down技術(shù)服務(wù)。

Halo/FLAG-tag pull down是使用基于真核的體外表達(dá)系統(tǒng)來表達(dá)目的蛋白,目的蛋白攜帶Halo/FLAG標(biāo)簽;GST-tag pull down是使用基于原核的體外蛋白表達(dá)系統(tǒng),或者大腸桿菌誘導(dǎo)表達(dá)目的蛋白,目的蛋白攜帶GST或His標(biāo)簽。

Halo/FLAG-tag pull down技術(shù)優(yōu)勢(shì):

真核表達(dá)系統(tǒng),蛋白更接近體內(nèi)結(jié)構(gòu)

沒有細(xì)胞內(nèi)干擾因素的限制,表達(dá)成功率高

蛋白表達(dá)載體構(gòu)建成功后,不需要轉(zhuǎn)化和鑒定,可直接表達(dá)目的蛋白,節(jié)省時(shí)間

步驟

內(nèi)容

交付內(nèi)容

周期

載體構(gòu)建

    ·       客戶提供目的蛋白對(duì)應(yīng)的CDS的序列或質(zhì)粒

    ·       克隆至合適的表達(dá)載體

    ·       質(zhì)粒測(cè)序

    ·       質(zhì)粒制備

測(cè)序結(jié)果

1-2周

無細(xì)胞表達(dá)+純化

    ·       用小麥芽胚蛋白表達(dá)體系進(jìn)行蛋白表達(dá)

     ·       蛋白表達(dá)評(píng)估 (Western Blot)

表達(dá)評(píng)估結(jié)果

1周

Pull Down

    ·       細(xì)胞裂解

    ·       目的蛋白和總蛋白孵育

    ·       洗脫與目的蛋白結(jié)合的蛋白

銀染結(jié)果

1周

質(zhì)譜檢測(cè)

    ·       將洗脫的蛋白進(jìn)行質(zhì)譜鑒定

質(zhì)譜結(jié)果

2-3周

生信分析

    ·       對(duì)質(zhì)譜鑒定到的基因進(jìn)行GO和KEGG的富集分析

生信分析結(jié)果

1周



聯(lián)


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