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DAP-seq:轉錄因子結合位點研究新方法

更新時間:2026-01-08

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簡要描述:
DAP-seq:轉錄因子結合位點研究新方法
DAP-Seq將蛋白質體外表達技術與高通量測序技術相結合,不需要針對每個轉錄因子制備特異性抗體,所以DAP-Seq具有快速、高通量、節(jié)約時間成本等顯著優(yōu)勢,比ChIP-seq更易于擴展。
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DAP-seq:轉錄因子結合位點研究新方法


在功能基因組學和表觀遺傳學研究中,轉錄因子結合位點(TFBS)的發(fā)掘一直是研究熱點。傳統(tǒng)的ChIP-seq(染色質免疫共沉淀測序)方法,在抗體質量很好的情況下能夠有效檢測到TFBS。然而,好的抗體可遇不可求,這限制了ChIP-seq更廣泛的應用。


DAP-seq技術的出現(xiàn),使TFBS 的研究不再局限于物種,不再受抗體質量的限制,為生命科學領域轉錄因子的研究提供了新的有效工具。


DAP-seq具有與ChIP-seq同樣的功能。通過體外蛋白表達技術,表達出帶有標簽的轉錄因子,和基因組DNA文庫在體外進行結合,然后分離出所有與轉錄因子結合的DNA,再使用高通量測序,找到轉錄因子的結合位點。


藍景科信為您提供DAP-seq全流程技術服務和個性化數(shù)據(jù)分析,具有100多個物種,2000多個轉錄因子的實戰(zhàn)經驗。歡迎咨詢。



DAP-seq:轉錄因子結合位點研究新方法


服務內容:

服務項目周期交付結果
蛋白表達載體構建1-2周

構建載體的測序結果

實驗過程圖

原始測序數(shù)據(jù)

分析結果

蛋白無細胞表達1-2周
DAP-seq文庫構建1周
DNA親和純化1-2周
上機測序2周
標準數(shù)據(jù)分析2周

       



已做物種:

植物

擬南芥

莖瘤芥

甘藍型油菜

白菜型油菜

不結球白菜

菜心

小麥

大麥

花生

辣椒

番茄

草莓

黃花棘豆

苦蕎

紅薯

木薯

馬鈴薯

普通煙草

人參

鴨茅

罌su

甘蔗

短芒大麥草

二色補血草

煙草

百脈根

芍藥

丹參

狗尾草

菠菜

玉米

大豆

高粱

藜麥

陸地棉

甜瓜

黃瓜

葡萄

灰氈毛忍冬

粉葛

三葉青

獼猴桃

香蕉

蒺藜苜蓿

紫花苜蓿

伴礦景天

苔蘚

地錢

毛果楊

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小黑楊

胡楊

山新楊

小葉楊

歐美楊

大青楊

毛白楊

剛毛檉柳

白樺

光皮樺

油松

毛竹

麻竹

銀杏

油桐

荔枝

柑橘

甜橙

歐洲云杉

核桃

柿子

閩楠

木荷

臍橙

板栗

杜梨

蘋果

櫻桃

麻瘋樹

茶樹

月季

海島棉

白木香

橡膠樹

三角褐指藻

芥藍

藍花耬斗菜

鹽芥

無花果

菠蘿

西瓜

甘薯

竹葉花椒

玫瑰

動物

飛蝗

新孢子蟲

煙粉虱

草地貪夜蛾

真菌

擬輪枝鐮孢菌

豬苓真菌

意大利青霉

草酸青霉

腐霉

金黃殼囊孢

靈芝

糙皮側耳

草菇

灰蓋鬼傘

蟲草

亞洲鐮刀菌

蝗綠僵菌


細菌

路德維希腸桿菌

嗜熱厭氧桿菌

生氮假單胞菌

伯克赫爾德氏菌

布魯氏菌

肺炎克雷伯菌


     







相關服務:

1、 凝膠阻滯實驗(EMSA):DAP-seq后續(xù)驗證服務。

2、 酵母單雜交:DAP-seq后續(xù)驗證服務

3、 ChIP-seq:高效檢測重組蛋白、轉錄因子在基因組的結合位點

4、 DAP-seq與RNA-seq聯(lián)合分析: 分析轉錄因子的靶基因在RNA-seq數(shù)據(jù)中的表達變化,深入挖掘DAP-seq和RNA-seq測序數(shù)據(jù),增加轉錄組測序的分析深度。

5、 DNA-pull down:鑒定與DNA結合的蛋白。

6、 精美的論文圖片設計與制作:專業(yè)設計師,設計精美論文插圖,提升論文的嚴謹性和美觀度。


DAP-seq:轉錄因子結合位點研究新方法

DAP-seq是基于DNA親和純化,通過體外表達轉錄因子鑒定TFBS的技術,具有不受抗體和物種限制,且高通量的優(yōu)勢,自該技術問世以來,已被廣泛應用于轉錄調控和表觀組學的研究。能幫助您快速找到轉錄因子的結合位點,尋找轉錄因子調控的靶基因。


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